Насколько я понимаю, m#^(\w+)(??{ exists $hash{$1} ? "" : "N/A" })$# ищет либо строку которая является ключем хэша %hash либо любую строку типа '^\w+N/A$'. То есть смысл A не совпадает со смыслом B.
кстати m#^$re$# было бы правильно если бы использовался qr. А без него нужно писать m#^(?:$re)$#
no subject
кстати m#^$re$# было бы правильно если бы использовался qr. А без него нужно писать m#^(?:$re)$#